公积金余额不足13月是不能进行代扣的。如果签订了按月代扣协议，那么公积金账户里面要留13个月余额，才能代扣成功。不满13个月余额时，则需要还款账户里面留足公积金月供的金额。另外也可以电话咨询住房公积金。
公积金代扣就是指公积金直接抵扣月供
一般需要满足公积金账户余额大于月供的3倍才能申请代扣业务，代扣业务申请后，公积金可以直接低月供，只要公积金账户余额够月供的情况下，会全额扣除，公积金账户余额不够月供了，会先把公积金账户的钱扣完，剩下的才从还款卡扣除。
公积金代缴利率不会随LPR变动。公积金贷款执行的是央行规定的贷款基准利率，该利率由中国人民银行调整决定，全国各地统一执行。公积金贷款利率一旦确定，通常不会变动，除非国家统一调整公积金贷款利率。
与公积金贷款利率不同，商业贷款（商贷）利率则是以相应期限的LPR（贷款市场报价利率）为定价基准加点形成，因此商贷利率与LPR有关，LPR发生变化时，商贷利率也会相应调整。